Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccl2P10148 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccl2P10148 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms