Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CatspereP0DP43 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms