Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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TtrP07309 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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TtrP07309 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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TtrP07309 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TtrP07309 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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TtrP07309 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TtrP07309 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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TtrP07309 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TtrP07309 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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TtrP07309 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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TtrP07309 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtrP07309 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtrP07309 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtrP07309 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtrP07309 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtrP07309 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtrP07309 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtrP07309 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtrP07309 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtrP07309 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtrP07309 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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