Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa4P06798 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxa4P06798 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms