Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06321 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06321 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06321 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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P06321 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06321 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06321 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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