Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JunP05627 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JunP05627 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JunP05627 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JunP05627 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms