Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
P01755 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01755 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01755 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01755 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01755 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01755 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01755 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01755 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01755 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01755 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01755 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01755 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01755 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01755 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01755 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01755 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01755 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms