Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01740 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01740 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01740 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01740 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01740 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01740 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01740 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms