Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01679 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01679 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01679 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01679 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01679 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01679 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms