Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01667 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01667 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01667 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01667 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01667 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01667 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01667 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01667 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01667 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01667 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01667 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01667 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01667 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01667 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01667 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01667 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01667 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01667 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01667 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01667 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01667 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01667 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01667 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms