Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ccl20O89093 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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