Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcn2O88968 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms