Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops3O88543 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops3O88543 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops3O88543 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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