Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dnmt3bO88509 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnmt3bO88509 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms