Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnmt3aO88508 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3aO88508 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms