Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CntfrO88507 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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