Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Col5a1O88207 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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