Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1O70583 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid1O70583 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid1O70583 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1O70583 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms