Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrna4O70174 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms