Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp2a2O55143 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms