Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms