Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc3O55013 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms