Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NlkO54949 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NlkO54949 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NlkO54949 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NlkO54949 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NlkO54949 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NlkO54949 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NlkO54949 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NlkO54949 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NlkO54949 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NlkO54949 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NlkO54949 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NlkO54949 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NlkO54949 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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