Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp10aO54827 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp10aO54827 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms