Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb10O35955 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms