Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf18O35714 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms