Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkd2O35245 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pkd2O35245 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms