Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sypl1O09117 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sypl1O09117 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms