Protein–RNA interactions for Protein: O09112

Dusp8, Dual specificity protein phosphatase 8, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp8O09112 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dusp8O09112 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dusp8O09112 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dusp8O09112 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dusp8O09112 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms