Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcm2O09102 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcm2O09102 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms