Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfra2O08842 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra2O08842 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms