Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClockO08785 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClockO08785 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClockO08785 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClockO08785 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClockO08785 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClockO08785 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClockO08785 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClockO08785 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClockO08785 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClockO08785 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClockO08785 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClockO08785 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClockO08785 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClockO08785 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClockO08785 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms