Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn5O08688 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms