Protein–RNA interactions for Protein: O08579

Emd, Emerin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EmdO08579 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EmdO08579 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EmdO08579 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EmdO08579 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EmdO08579 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EmdO08579 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EmdO08579 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EmdO08579 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EmdO08579 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EmdO08579 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EmdO08579 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EmdO08579 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EmdO08579 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EmdO08579 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EmdO08579 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms