Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MsmbO08540 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MsmbO08540 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms