Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20878L7N244 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20878L7N244 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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