Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Vmn2r88L7N1W8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Vmn2r88L7N1W8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Vmn2r88L7N1W8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Vmn2r88L7N1W8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Vmn2r88L7N1W8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Vmn2r88L7N1W8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Vmn2r88L7N1W8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Vmn2r88L7N1W8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Vmn2r88L7N1W8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Vmn2r88L7N1W8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Vmn2r88L7N1W8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Vmn2r88L7N1W8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Vmn2r88L7N1W8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Vmn2r88L7N1W8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn2r88L7N1W8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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