Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21310J3QQ23 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21310J3QQ23 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21310J3QQ23 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm21310J3QQ23 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm21310J3QQ23 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm21310J3QQ23 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm21310J3QQ23 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm21310J3QQ23 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21310J3QQ23 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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