Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm2056J3QQ02 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms