Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccer2J3QPU5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms