Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700014D04RikJ3QMS2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700014D04RikJ3QMS2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms