Protein–RNA interactions for Protein: I6XKQ3

Spdye4c, Speedy/RINGO cell cycle regulator family, member E4C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4cI6XKQ3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdye4cI6XKQ3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdye4cI6XKQ3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdye4cI6XKQ3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdye4cI6XKQ3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdye4cI6XKQ3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdye4cI6XKQ3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdye4cI6XKQ3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdye4cI6XKQ3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdye4cI6XKQ3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdye4cI6XKQ3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdye4cI6XKQ3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdye4cI6XKQ3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spdye4cI6XKQ3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spdye4cI6XKQ3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms