Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pabpc4lG5E8X2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc4lG5E8X2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms