Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arfip1G5E8V9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms