Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4933406M09RikG3XA12 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms