Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Vmn1r167G3UW71 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Vmn1r167G3UW71 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Vmn1r167G3UW71 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Vmn1r167G3UW71 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Vmn1r167G3UW71 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Vmn1r167G3UW71 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Vmn1r167G3UW71 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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