Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd5G3UW60 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms