Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn2r85G3UW56 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms