Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r76F8VQ63 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r76F8VQ63 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r76F8VQ63 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r76F8VQ63 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r76F8VQ63 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r76F8VQ63 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r76F8VQ63 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r76F8VQ63 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r76F8VQ63 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r76F8VQ63 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms