Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Colca2F8VPY8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Colca2F8VPY8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms